|
★グラフニューラルネットワーク(GNN)を用いた材料特性予測とは!
★分子シミュレーションとタンパク質言語モデルを用いた学習データの拡充!
第1節 「実験を伴う研究開発」領域におけるAI技術の活用
はじめに
1.研究開発現場へのAI導入とその活用
1.1 AI導入・活用の目的
1.2 AI活用の効果試算
1.3 AI導入に際する留意事項
2.実験・研究データの「生成」
2.1 キャラクタリゼーションからジェネレーションへ
2.2 Generated dataの留意事項
3.ハイスループット実験システムの構築
3.1 材料開発領域における考え方
3.2 HT実験による目的変数取得
3.3 インク,トナー開発における事例
おわりに
第2節 材料のグラフ表現と深層学習を組み合わせた材料特性の予測モデルと材料マップの構築
はじめに
1.材料科学におけるグラフ表現の基礎
1.1 なぜグラフ表現なのか
1.2 結晶・分子のグラフ化手法
2.主要なGNNモデルと材料予測への応用
2.1 代表的なGNNモデル
2.2 汎用原子間ポテンシャル
2.3 大規模材料探索への応用事例
3.GNNを使った材料マップ
3.1 機械学習を活用した実験データと計算データを統合した材料特性予測モデルの開発
4.結果と考察
第3節 多成分系組成物の開発に求められる機械学習の予測性と解釈性
はじめに
1.皮膚洗浄剤開発の特徴
2.機械学習を用いた材料開発の研究動向
2.1 計算科学と機械学習
2.2 多成分系組成物における機械学習の予測性
2.3 多成分系組成物における機械学習の解釈性
3.皮膚洗浄剤組成物への機械学習の応用例
3.1 機械学習の外挿性を向上する特徴量生成
3.2 機械学習の解釈性を向上するアルゴリズム設計
おわりに
第4節 AI創薬研究の歴史と,予測AI,生成AI活用のポイント
はじめに
1.AI創薬の歩みと現在の立ち位置
1.1 コンピュータ創薬の歴史における技術的基盤と役割
1.2 AI自体の歴史における過去のブームと挫折
1.3 AIの歴史上における形式的な変化
1.3.1 最初に登場したAI:ルールベース型AI
1.3.2 データサイエンスとしてのAI ; パーセプトロンやニューラルネットワーク
1.3.3 より知的な作業が期待できるAI;深層学習型ニューラルネットワーク
1.3.4 画像解析や言語解析,翻訳型AIの展開と発達
1.4 言語解析型AI導入による化学/創薬分野のAlphaFold 2
1.5 AIによる異分野融合研究,学際的研究の推進
2.AI創薬の歴史と発展
2.1 コンピュータ支援創薬およびAI創薬の歴史的展開
2.2 過去の技術的変化と展開
2.3 蛋白三次元構造創出:AlphaFold 2
2.4 AlphaFold 2の高い三次元構造創出能力
2.5 Attention適用と,AI及び蛋白研究との融合研究としての成果:AlphaFold
2
3.予測AIの展開と発展
3.1 予測AI実施上での留意点
3.2 予測実施時の一般的な留意項目:データ/パラメータ/解析手法関連事項
3.2.1 データ関連事項
3.2.2 解析上での留意事項
3.2.3 データ解析実施過程での留意事項
3.2.4 データ解析実施後の留意事項
4.生成AIの展開と現状及びまとめ
第5節 分子シミュレーションとタンパク質言語モデルを組み合わせた教師データの拡張と予測精度向上
はじめに
1.手法概要
2.計算値の作成
2.1 分子シミュレーション
2.2 タンパク質言語モデル
2.3 ハイブリッド値
3.計算値による精度低下を防止するアルゴリズム
3.1 実験データの量に応じた動的重みづけ
3.2 計算値の採否アルゴリズム
3.3 機械学習モデルと検証用データ
4.予測結果
4.1 機械学習モデルの予測精度の向上
4.2 動的重みづけ,採否アルゴリズムの効果
4.3 Hit変異体の探索への応用
4.4 複数箇所の変異への応用
5.考察と今後の展望
謝辞
第6節 AIを活用した物質の合成条件予測と精度向上
はじめに:研究開発における物質探索と合成予測の課題
1.Chemically Relevant Compositionの概念
2.従来のAI・データ駆動型物質探索手法の整理
2.1 第一原理計算に基づく材料探索
2.2 組成記述子を用いた機械学習手法
2.3 ハイスループット実験およびロボット合成
2.4 従来手法の課題と推薦システムの位置づけ
3.推薦システムによる化学組成予測と合成実証例
3.1 化学組成予測における推薦スコアの意味
3.2 記述子ベースおよびテンソル分解ベース手法
3.3 推薦結果の外部検証と合成候補の選定
3.4 推薦に基づく合成実証例
3.5 組成予測から次の段階へ
4.合成条件予測への拡張:合成条件推薦システム
4.1 合成条件探索における課題
4.2 並列実験データに基づく学習データの構築
4.3 合成条件空間のテンソル表現と分解
4.4 推薦スコアと合成成功率の関係
4.5 新規化合物発見への適用例
4.6 合成条件推薦システムの位置づけ
5.多元系組成探索に向けたテンソル埋め込み手法の高度化
5.1 擬二元系データのみを用いる発想
5.2 エンドメンバーのテンソル埋め込み
5.3 多元系組成のベクトル化と予測モデル
5.4 系全体を評価するという新しい視点
5.5 合成研究への示唆
6.研究開発現場における活用指針と実装上の注意点
6.1 推薦スコアの解釈と使い方
6.2 個別組成ではなく「系」を見るという視点
6.3 合成条件推薦の現場実装における注意点
6.4 データバイアスと適用範囲の理解
6.5 AIと研究者の役割分担
7.ロボット実験・協働実験との統合に向けた将来展望
7.1 人手実験の限界と自動化の必要性
7.2 推薦システムとの相補的関係
7.3 クローズドループ型材料探索の可能性
7.4 実装に向けた課題
7.5 人とAIの協働という視点
まとめ
第7節 薬剤の反応を予測するAI技術の開発と活用
はじめに
1.薬剤応答予測の枠組みと技術構成
1.1 技術構成の概要
1.2 ナレッジグラフ
1.3 ナレッジグラフとリンク予測
1.4 統合データの性質と利用方針
1.5 データ統合とエンティティ正規化
1.6 リンク予測による薬効スコアの推定
1.7 薬剤応答推定の実証
2.文献検索AIとの連携による根拠確認
3.他領域への応用可能性
おわりに
第8節 生成AIが拓く研究開発の新時代 〜文献解析から実験自動化まで:統合プラットフォームの展望〜
はじめに
1.学術情報界隈のツールの変遷
1.1 Google Scholar
1.2 ResearchGate
1.3 学術俯瞰システム
1.4 Paper Digest
1.5 GPTs
2.生成AIを組み合わせた論文解析や事業展開への応用の可能性 〜Climate Techの事例〜
2.1 生成AIを用いた公開情報の俯瞰
2.2 論文解析による学術俯瞰
2.3 生成AIで事業展開への応用の可能性のアイディエーション
2.4 今後の生成AIを用いた学術俯瞰のあり方
3.生成AIを研究開発に使う際の注意点
4.むすび 〜研究開発における生成AIの未来〜
4.1 自律的な研究開発の萌芽
4.2 研究開発プロセスの統合
4.3 次世代研究開発プラットフォームの展望
|